Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVEP1Q4LDE5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms