Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP100Q494V2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP100Q494V2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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