Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms