Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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