Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HMGN3Q15651 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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