Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SF3A2Q15428 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SF3A2Q15428 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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