Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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COL4A6Q14031 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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COL4A6Q14031 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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COL4A6Q14031 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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COL4A6Q14031 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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