Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CIRBPQ14011 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CIRBPQ14011 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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