Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRQ13535 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRQ13535 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRQ13535 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRQ13535 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRQ13535 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATRQ13535 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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