Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTK7Q13308 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTK7Q13308 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTK7Q13308 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTK7Q13308 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTK7Q13308 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTK7Q13308 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTK7Q13308 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTK7Q13308 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms