Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 NUP145YGL092W 3954 nt1.3□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 SPC98YNL126W 2541 nt1.3□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 PXA2YKL188C 2562 nt1.29□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.29□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YIL059CYIL059C 366 nt1.29□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 LAA1YJL207C 6045 nt1.29□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 MSH3YCR092C 3057 nt1.28□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YLR422WYLR422W 5799 nt1.28□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YLL020CYLL020C 306 nt1.28□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 snR54snR54 86 nt1.28□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 GUP1YGL084C 1683 nt1.28□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 NUP192YJL039C 5052 nt1.28□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 SAS3YBL052C 2496 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 SPT21YMR179W 2277 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YLR419WYLR419W 4308 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 RPF1YHR088W 888 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YNL303WYNL303W 348 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 RPL32YBL092W 393 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 RFX1YLR176C 2436 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 AIM44YPL158C 2277 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 APL1YJR005W 2103 nt1.27□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 PIP2YOR363C 2991 nt1.26□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YGR045CYGR045C 363 nt1.26□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 ECL1YGR146C 636 nt1.26□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 CDC31YOR257W 486 nt1.26□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 SCC2YDR180W 4482 nt1.26□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 ENV11YGR071C 2583 nt1.25□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YDR269CYDR269C 324 nt1.25□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 BI2Q0110 1272 nt1.25□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.25□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 PHS1YJL097W 654 nt1.25□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 SDH2YLL041C 801 nt1.25□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.25□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 CDC25YLR310C 4770 nt1.25□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YLL032CYLL032C 2478 nt1.25□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 PMD1YER132C 5262 nt1.24□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 APL2YKL135C 2181 nt1.24□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 TRM732YMR259C 4263 nt1.24□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 SRP14YDL092W 441 nt1.24□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.24□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.24□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YLR171WYLR171W 390 nt1.24□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 NUP188YML103C 4968 nt1.23□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 ALY2YJL084C 3141 nt1.23□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 NFU1YKL040C 771 nt1.23□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.23□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 RUF22RUF22 515 nt1.23□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 EFR3YMR212C 2349 nt1.23□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 MPT5YGL178W 2580 nt1.23□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YGR290WYGR290W 444 nt1.22□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.22□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 AIM29YKR074W 468 nt1.22□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 NUT2YPR168W 474 nt1.22□□□□□ -2.21
NFI1Q12216 ZEO1YOL109W 342 nt1.21□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 YBR012CYBR012C 420 nt1.21□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 VAM6YDL077C 3150 nt1.21□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 DOP1YDR141C 5097 nt1.21□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 PRE4YFR050C 801 nt1.2□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 TIM13YGR181W 318 nt1.2□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 MRPL31YKL138C 396 nt1.2□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 YKL202WYKL202W 582 nt1.2□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 UPS1YLR193C 528 nt1.2□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 APL3YBL037W 3078 nt1.2□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 EAF1YDR359C 2949 nt1.19□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 SCW11YGL028C 1629 nt1.19□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.19□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 DIE2YGR227W 1578 nt1.18□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 RPL34BYIL052C 366 nt1.18□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 ERP4YOR016C 624 nt1.18□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.18□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 YHL037CYHL037C 402 nt1.17□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 YLR287CYLR287C 1068 nt1.17□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 STB6YKL072W 2301 nt1.16□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.16□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 YBL071CYBL071C 309 nt1.16□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 RPL33BYOR234C 324 nt1.16□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 LOA1YPR139C 903 nt1.16□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 MMS4YBR098W 2076 nt1.16□□□□□ -2.22
NFI1Q12216 YDL011CYDL011C 324 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 snR14snR14 160 nt1.15□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.14□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 SLI15YBR156C 2097 nt1.13□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 FYV7YLR068W 456 nt1.13□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 RRT1YBL048W 312 nt1.13□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 NUP157YER105C 4176 nt1.12□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.12□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.12□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 UBP3YER151C 2739 nt1.12□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 SET3YKR029C 2256 nt1.12□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 MDS3YGL197W 4464 nt1.11□□□□□ -2.23
NFI1Q12216 NPC2YDL046W 522 nt1.11□□□□□ -2.23
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