Protein–RNA interactions for Protein: Q12133

SPC3, Signal peptidase complex subunit SPC3, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC3Q12133 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 GMC2YLR445W 567 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 WAR1YML076C 2835 nt0.23□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 HNT1YDL125C 477 nt0.22□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.22□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 LCD1YDR499W 2244 nt0.22□□□□□ -2.37
SPC3Q12133 SPO23YBR250W 1572 nt0.21□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 snR79snR79 84 nt0.21□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.21□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.21□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 AI1Q0050 2505 nt0.2□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 LOC1YFR001W 615 nt0.2□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YGR290WYGR290W 444 nt0.2□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.2□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 ACF4YJR083C 930 nt0.2□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.2□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YCK3YER123W 1575 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 HTB1YDR224C 396 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 UPS1YLR193C 528 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YOL106WYOL106W 354 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YOR282WYOR282W 321 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 PPN1YDR452W 2025 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 BFR2YDR299W 1605 nt0.19□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 IQG1YPL242C 4488 nt0.18□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.18□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 SPO13YHR014W 876 nt0.18□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YPR170CYPR170C 336 nt0.18□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 CHS6YJL099W 2241 nt0.18□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 ENV11YGR071C 2583 nt0.17□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 MET32YDR253C 576 nt0.17□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 TDA2YER071C 381 nt0.17□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YHR054CYHR054C 1065 nt0.17□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 BIR1YJR089W 2865 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YDR008CYDR008C 351 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 WIP1YDR374W-A 270 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 SLX9YGR081C 633 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 RRT1YBL048W 312 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 TRS65YGR166W 1683 nt0.16□□□□□ -2.38
SPC3Q12133 PAN3YKL025C 2040 nt0.15□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.15□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 YGR042WYGR042W 816 nt0.15□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 COX7YMR256C 183 nt0.15□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 YPR099CYPR099C 357 nt0.15□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 PMP1YCR024C-A 123 nt0.14□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 QCR7YDR529C 384 nt0.14□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.14□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.14□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 MLP2YIL149C 5040 nt0.14□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 PAU12YGR294W 363 nt0.13□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 RPS24BYIL069C 408 nt0.13□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 PHS1YJL097W 654 nt0.13□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 YBR071WYBR071W 636 nt0.13□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 SLI15YBR156C 2097 nt0.13□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 NPR2YEL062W 1848 nt0.13□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 YPL197CYPL197C 414 nt0.12□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 NOP9YJL010C 2001 nt0.12□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 RRI2YOL117W 1938 nt0.12□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 BEM3YPL115C 3387 nt0.12□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 snR84snR84 550 nt0.11□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 SBH1YER087C-B 249 nt0.11□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 RPL9AYGL147C 576 nt0.11□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 POL32YJR043C 1053 nt0.11□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 RPL26AYLR344W 384 nt0.11□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 IPI3YNL182C 1668 nt0.11□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 YHL042WYHL042W 453 nt0.1□□□□□ -2.39
SPC3Q12133 RPL26BYGR034W 384 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 RSM27YGR215W 333 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 TIM10YHR005C-A 282 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 LRP1YHR081W 555 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YKL111CYKL111C 336 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YNL150WYNL150W 408 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YOL014WYOL014W 375 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.09□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YLL032CYLL032C 2478 nt0.08□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 TAD1YGL243W 1203 nt0.08□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 MLP1YKR095W 5628 nt0.08□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 ESP1YGR098C 4893 nt0.07□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 QCR9YGR183C 201 nt0.07□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 SPO11YHL022C 1197 nt0.07□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.07□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 LOA1YPR139C 903 nt0.07□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 STE5YDR103W 2754 nt0.06□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 NPC2YDL046W 522 nt0.06□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 RPC10YHR143W-A 213 nt0.06□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 LIN1YHR156C 1023 nt0.06□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 RPL32YBL092W 393 nt0.06□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.06□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 RSM23YGL129C 1353 nt0.06□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 YLR252WYLR252W 306 nt0.05□□□□□ -2.4
SPC3Q12133 MRPL31YKL138C 396 nt0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.5 ms