Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 ATG11YPR049C 3537 nt3.45□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 PRP5YBR237W 2550 nt3.45□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 CRM1YGR218W 3255 nt3.44□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 DYN2YDR424C 279 nt3.44□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 RPS8AYBL072C 603 nt3.44□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 RRP5YMR229C 5190 nt3.44□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 NAM7YMR080C 2916 nt3.44□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 DUG2YBR281C 2637 nt3.43□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 SET2YJL168C 2202 nt3.43□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt3.43□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 SSM4YIL030C 3960 nt3.43□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 STE6YKL209C 3873 nt3.43□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 AFI1YOR129C 2682 nt3.43□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 ZIP1YDR285W 2628 nt3.42□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 ANB1YJR047C 474 nt3.42□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 MIT1YEL007W 2001 nt3.42□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 SMC2YFR031C 3513 nt3.42□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 snR81snR81 201 nt3.41□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt3.41□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 RRP6YOR001W 2202 nt3.41□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 CAT2YML042W 2013 nt3.41□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 ZIP2YGL249W 2115 nt3.4□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 AKR1YDR264C 2295 nt3.4□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 TSC11YER093C 4293 nt3.4□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 VMR1YHL035C 4779 nt3.4□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 ZRG8YER033C 3231 nt3.39□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 SLM1YIL105C 2061 nt3.39□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YME2YMR302C 2553 nt3.39□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 MDN1YLR106C 14733 nt3.39□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 SNC1YAL030W 354 nt3.39□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt3.39□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 SEC63YOR254C 1992 nt3.39□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 PAU10YDR542W 363 nt3.38□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 PAU11YGL261C 363 nt3.38□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 PAU4YLR461W 363 nt3.38□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 TRS120YDR407C 3870 nt3.38□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt3.37□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 HSH155YMR288W 2916 nt3.37□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 ENA5YDR038C 3276 nt3.37□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YDR186CYDR186C 2634 nt3.37□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 STE11YLR362W 2154 nt3.36□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 RIF1YBR275C 5751 nt3.36□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 CRS5YOR031W 210 nt3.36□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.36□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 SMC3YJL074C 3693 nt3.36□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YLL054CYLL054C 2532 nt3.36□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YMR317WYMR317W 3423 nt3.36□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 IFH1YLR223C 3258 nt3.36□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 INP53YOR109W 3324 nt3.36□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 IKI3YLR384C 4050 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 MAD1YGL086W 2250 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 SWR1YDR334W 4545 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 VPS16YPL045W 2397 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 DSE4YNR067C 3354 nt3.35□□□□□ -1.87
TFB4Q12004 IRC8YJL051W 2469 nt3.34□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 MGM1YOR211C 2646 nt3.34□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 RGR1YLR071C 3249 nt3.33□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 YHR080CYHR080C 4038 nt3.33□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 QCR9YGR183C 201 nt3.33□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt3.33□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt3.33□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 SKP2YNL311C 2292 nt3.33□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 TAF1YGR274C 3201 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 ROM1YGR070W 3468 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 RPA135YPR010C 3612 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 PTP2YOR208W 2253 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 TAO3YIL129C 7131 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 TAF2YCR042C 4224 nt3.32□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 YGL182CYGL182C 324 nt3.31□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.31□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 ENV11YGR071C 2583 nt3.31□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 SAS3YBL052C 2496 nt3.31□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 YNL018CYNL018C 1839 nt3.3□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 TTI1YKL033W 3117 nt3.3□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 ACB1YGR037C 264 nt3.3□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt3.3□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 KTI11YBL071W-A 249 nt3.3□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 SLA1YBL007C 3735 nt3.3□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 GCV2YMR189W 3105 nt3.3□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 CHS2YBR038W 2892 nt3.3□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 DGR2YKL121W 2559 nt3.29□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 RPA190YOR341W 4995 nt3.29□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 SLX4YLR135W 2247 nt3.29□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.28□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 VAS1YGR094W 3315 nt3.28□□□□□ -1.88
TFB4Q12004 SDC25YLL016W 3147 nt3.27□□□□□ -1.89
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