Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLFN5Q08AF3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN5Q08AF3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms