Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTDSPL2Q05D32 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms