Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALD1Q05682 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms