Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN12Q05209 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN12Q05209 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms