Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPTBN1Q01082 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms