Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNI2P48788 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms