Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LHX1P48742 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX1P48742 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX1P48742 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX1P48742 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX1P48742 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX1P48742 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX1P48742 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX1P48742 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LHX1P48742 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LHX1P48742 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LHX1P48742 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LHX1P48742 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LHX1P48742 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms