Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LSSP48449 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSSP48449 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSSP48449 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSSP48449 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSSP48449 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSSP48449 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSSP48449 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSSP48449 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSSP48449 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSSP48449 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSSP48449 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSSP48449 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSSP48449 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSSP48449 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSSP48449 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms