Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 PNC1YGL037C 651 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YGR050CYGR050C 357 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 RPS22AYJL190C 393 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 PAU8YAL068C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 PAU18YLL064C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 PAU6YNR076W 363 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 PAU20YOL161C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 RPL33AYPL143W 324 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 MSC6YOR354C 2079 nt2.67□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YCR043CYCR043C 384 nt2.66□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YHR210CYHR210C 1026 nt2.66□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YIL174WYIL174W 228 nt2.66□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.66□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 MNE1YOR350C 1992 nt2.66□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 ATG11YPR049C 3537 nt2.65□□□□□ -1.98
YAR028WP39548 YJL120WYJL120W 324 nt2.65□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 RPL34BYIL052C 366 nt2.64□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 YLR012CYLR012C 300 nt2.64□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 RPS25BYLR333C 327 nt2.64□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 TAO3YIL129C 7131 nt2.64□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 MET6YER091C 2304 nt2.63□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 YOR296WYOR296W 3870 nt2.63□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 COY1YKL179C 2040 nt2.63□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 HOS4YIL112W 3252 nt2.63□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 MSB2YGR014W 3921 nt2.62□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 PUT3YKL015W 2940 nt2.62□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 POL3YDL102W 3294 nt2.62□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 AXL1YPR122W 3627 nt2.61□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 UTP14YML093W 2700 nt2.61□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 YCL046WYCL046W 324 nt2.61□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 PAU10YDR542W 363 nt2.6□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 PAU11YGL261C 363 nt2.6□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 PAU4YLR461W 363 nt2.6□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.6□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 YME2YMR302C 2553 nt2.6□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 VTC3YPL019C 2508 nt2.6□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 NCA2YPR155C 1851 nt2.59□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 YDL196WYDL196W 330 nt2.59□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 YBL109WYBL109W 336 nt2.59□□□□□ -1.99
YAR028WP39548 RLM1YPL089C 2031 nt2.59□□□□□ -2
YAR028WP39548 HAL9YOL089C 3093 nt2.59□□□□□ -2
YAR028WP39548 TFC8YPL007C 1767 nt2.59□□□□□ -2
YAR028WP39548 AMS1YGL156W 3252 nt2.59□□□□□ -2
YAR028WP39548 YFR016CYFR016C 3702 nt2.58□□□□□ -2
YAR028WP39548 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.58□□□□□ -2
YAR028WP39548 ZRG17YNR039C 1818 nt2.58□□□□□ -2
YAR028WP39548 SIR3YLR442C 2937 nt2.57□□□□□ -2
YAR028WP39548 ATP7YKL016C 525 nt2.57□□□□□ -2
YAR028WP39548 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.57□□□□□ -2
YAR028WP39548 NAM7YMR080C 2916 nt2.57□□□□□ -2
YAR028WP39548 MRD1YPR112C 2664 nt2.56□□□□□ -2
YAR028WP39548 RPO41YFL036W 4056 nt2.56□□□□□ -2
YAR028WP39548 RAD34YDR314C 2079 nt2.56□□□□□ -2
YAR028WP39548 PAU3YCR104W 375 nt2.56□□□□□ -2
YAR028WP39548 SRO77YBL106C 3033 nt2.55□□□□□ -2
YAR028WP39548 SAP1YER047C 2694 nt2.55□□□□□ -2
YAR028WP39548 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.55□□□□□ -2
YAR028WP39548 BCK1YJL095W 4437 nt2.55□□□□□ -2
YAR028WP39548 YPL216WYPL216W 3309 nt2.55□□□□□ -2
YAR028WP39548 ZIP2YGL249W 2115 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 NOC3YLR002C 1992 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 ESL2YKR096W 3588 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 HSH155YMR288W 2916 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 YPR203WYPR203W 309 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 CAT2YML042W 2013 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 PIG1YLR273C 1947 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 FIG4YNL325C 2640 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 ENV11YGR071C 2583 nt2.54□□□□□ -2
YAR028WP39548 GEA1YJR031C 4227 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YER138CYER138C 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YER160CYER160C 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YJR027WYJR027W 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YML039WYML039W 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YML045WYML045W 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YMR050CYMR050C 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 JSN1YJR091C 3276 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 BRP1YGL007W 378 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 ACM1YPL267W 630 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.53□□□□□ -2
YAR028WP39548 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.52□□□□□ -2.01
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