Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6P35125 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6P35125 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6P35125 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6P35125 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6P35125 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6P35125 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6P35125 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6P35125 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6P35125 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6P35125 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6P35125 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6P35125 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6P35125 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6P35125 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP6P35125 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP6P35125 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP6P35125 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP6P35125 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP6P35125 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP6P35125 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6P35125 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6P35125 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6P35125 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6P35125 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6P35125 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6P35125 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6P35125 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6P35125 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6P35125 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6P35125 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6P35125 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6P35125 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms