Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CIITAP33076 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CIITAP33076 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIITAP33076 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIITAP33076 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIITAP33076 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms