Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA9P31269 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms