Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSSP25774 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSSP25774 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSSP25774 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSSP25774 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms