Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM21P19474 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM21P19474 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms