Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT3P12035 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT3P12035 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT3P12035 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT3P12035 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT3P12035 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT3P12035 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms