Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf88P0DMB2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms