Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PGA3P0DJD8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGA3P0DJD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms