Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSF1RP07333 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSF1RP07333 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms