Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAP4K4O95819 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms