Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN7O95471 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms