Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP19O94966 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP19O94966 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP19O94966 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP19O94966 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP19O94966 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP19O94966 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP19O94966 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP19O94966 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP19O94966 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP19O94966 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP19O94966 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP19O94966 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP19O94966 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP19O94966 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP19O94966 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP19O94966 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP19O94966 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP19O94966 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP19O94966 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP19O94966 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP19O94966 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP19O94966 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP19O94966 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP19O94966 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP19O94966 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP19O94966 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP19O94966 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
USP19O94966 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP19O94966 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP19O94966 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP19O94966 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP19O94966 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP19O94966 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP19O94966 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP19O94966 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP19O94966 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP19O94966 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP19O94966 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms