Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC9O60706 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC9O60706 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms