Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MARCH6O60337 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms