Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA5O60264 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA5O60264 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms