Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPAA1O43292 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPAA1O43292 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms