Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAPO00193 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAPO00193 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAPO00193 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAPO00193 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAPO00193 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms