Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QKU1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QKU1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QKU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3QKU1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
J3QKU1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
J3QKU1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
J3QKU1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms