Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPL5P28-201ENST00000418634 693 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC132217.1-201ENST00000430034 373 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL773572.1-202ENST00000440221 1004 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC242426.2-201ENST00000446956 795 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 FAR2P3-205ENST00000447059 604 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AF186996.1-201ENST00000466578 1015 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SLC17A1-203ENST00000468082 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 Z99943.2-201ENST00000507585 266 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC084251.1-201ENST00000521867 382 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AP000873.3-201ENST00000531869 766 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PRB4-203ENST00000535904 796 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC010809.2-201ENST00000560404 964 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 OR4C45-201ENST00000568934 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 DYM-207ENST00000578396 755 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC015911.8-201ENST00000592517 560 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC026150.3-201ENST00000602595 499 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MIR4435-2HG-217ENST00000604981 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.29-201ENST00000616220 280 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC245041.1-201ENST00000619523 826 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC087645.3-201ENST00000624708 587 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ASTE1-201ENST00000264992 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PLCE1-AS1-201ENST00000425267 1370 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC010200.1-201ENST00000547380 1454 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 IBSP-201ENST00000226284 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NSD1-216ENST00000638627 1866 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TAOK3-209ENST00000537952 2147 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PBLD-202ENST00000309049 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL589642.1-201ENST00000430787 2582 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 GEMIN6-201ENST00000281950 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 PLGLB1-201ENST00000355705 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NR1I3-205ENST00000367983 1473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 DCLRE1C-203ENST00000378242 1933 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TRIM5-201ENST00000380027 2290 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TRBV7-5-201ENST00000390382 345 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CAPNS1P1-201ENST00000401029 633 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL357084.1-201ENST00000407538 454 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL117378.1-202ENST00000421310 601 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC244034.1-201ENST00000428027 792 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL008638.1-201ENST00000430468 473 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 IGKV1D-35-201ENST00000442736 271 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 ENOX1-AS1-201ENST00000444442 3907 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PDCD1Q15116 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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