Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 PXT1-201ENST00000454782 2108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 MAP3K19-205ENST00000392917 1765 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 MGC27382-202ENST00000436742 1993 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 KRTAP11-1-201ENST00000332378 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 FXYD1-201ENST00000351325 592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RNA5SP426-201ENST00000362901 121 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RN7SKP208-201ENST00000365474 361 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AL023755.1-203ENST00000422253 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC024082.1-201ENST00000435250 699 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 Z98747.1-201ENST00000438791 356 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RPSAP64-201ENST00000451820 336 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 LINC00945-201ENST00000453716 753 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 NPSR1-208ENST00000465305 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RN7SL146P-201ENST00000472338 297 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC093270.1-201ENST00000482584 486 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RN7SL630P-201ENST00000483714 297 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 PRB4-203ENST00000535904 796 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC024270.2-201ENST00000568441 499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC009121.1-201ENST00000574681 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 RN7SL353P-201ENST00000579902 252 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 SRP68P1-201ENST00000584247 269 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC067796.1-201ENST00000586795 496 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AL627309.1-205ENST00000610542 723 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 LYG2-206ENST00000626374 650 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TMEM225BP0DP42 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 EEF1A1P11-201ENST00000415278 1389 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 OPALIN-205ENST00000536387 3392 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 FBXO9-203ENST00000370939 1580 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 ARNTL2-201ENST00000261178 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 SNORA73A-201ENST00000364938 206 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 AIF1-203ENST00000376059 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 AC096664.1-201ENST00000393996 778 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 CFL1P8-201ENST00000436148 475 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 AC002366.1-201ENST00000446186 1190 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TMEM225BP0DP42 LINC01432-201ENST00000449427 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms