Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LINC00641-202ENST00000555688 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 FGL1-202ENST00000381841 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 SMCO2-201ENST00000298876 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 OR56A1-201ENST00000316650 1071 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 RNA5SP426-201ENST00000362901 121 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 S100A13-202ENST00000392622 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 SMCO2-202ENST00000416383 1272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 RPL26P34-201ENST00000431005 451 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 CYP4A22-AS1-201ENST00000444042 921 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC005840.2-201ENST00000447193 355 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LIF-AS1-201ENST00000447565 808 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LINC01432-201ENST00000449427 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 NDUFB11P1-201ENST00000455818 465 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AL031727.1-201ENST00000457263 455 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 RN7SL130P-201ENST00000489463 305 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC027338.2-201ENST00000504382 526 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 ENPP7P10-201ENST00000504828 933 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC100818.1-202ENST00000523748 578 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 CYP19A1-210ENST00000557858 832 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC087565.1-201ENST00000565061 391 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC090287.1-201ENST00000578374 291 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 HIGD1B-203ENST00000587021 457 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 MIR4435-2HG-217ENST00000604981 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC073218.2-201ENST00000606468 295 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AL592227.1-201ENST00000614748 126 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 GPC6-202ENST00000617456 792 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.20-201ENST00000619896 275 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 C1orf137-201ENST00000624685 386 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PDK4Q16654 OR56A1-204ENST00000641938 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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PDK4Q16654 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC093826.2-201ENST00000579042 108 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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PDK4Q16654 AL358394.3-202ENST00000599308 832 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL109806.1-201ENST00000623967 1248 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 LINC01176-202ENST00000628121 716 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL139220.2-211ENST00000628234 754 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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