Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL121785.1-201ENST00000624745 708 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CDKL5-209ENST00000635828 3823 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC131935.2-201ENST00000623649 1371 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HKR1-202ENST00000392153 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 WDR11-AS1-203ENST00000598981 2242 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PATE2-201ENST00000358524 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SIRPD-202ENST00000381623 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IPP-202ENST00000396478 3113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNF728-201ENST00000594710 2015 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC025580.2-204ENST00000560077 2399 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SUGT1P3-201ENST00000304932 1051 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 OR2D3-201ENST00000317834 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 OR1J2-201ENST00000335302 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL645937.5-202ENST00000415595 944 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL121990.1-201ENST00000417605 591 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HLA-DQB1-AS1-201ENST00000419852 552 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 SDHDP2-201ENST00000436937 465 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ASH2LP1-201ENST00000438037 985 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ASS1P4-201ENST00000439462 1234 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CYP4F25P-201ENST00000446871 520 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL353194.1-201ENST00000451507 441 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC018638.4-201ENST00000465971 1150 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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PDCD1Q15116 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC004009.3-201ENST00000624160 645 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.211-201ENST00000635920 276 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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