Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 C8orf87-201ENST00000521906 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC018448.2-201ENST00000548295 305 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CYP1A1-205ENST00000564596 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC013565.2-201ENST00000564874 310 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF286A-214ENST00000581529 560 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CDC37L1-AS1-201ENST00000607997 463 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TTR-205ENST00000613781 556 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC01206-219ENST00000625703 820 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NOS1-202ENST00000338101 4462 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CCDC129-202ENST00000407970 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RNF138-201ENST00000257190 2071 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PPP3CA-205ENST00000507176 1958 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FCGR3B-204ENST00000531221 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PAX8-AS1-213ENST00000609210 1328 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FXR1-203ENST00000445140 2651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TP63-204ENST00000392460 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 EIF3H-201ENST00000276682 2041 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SOCS5P4-201ENST00000454743 1566 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF502-204ENST00000449836 3173 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 GSTA4-202ENST00000370960 859 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MIR185-201ENST00000385288 82 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CNN2P7-201ENST00000400583 932 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC064862.3-201ENST00000411435 571 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL683807.1-201ENST00000427886 445 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 G6PC2-204ENST00000429379 645 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL139220.2-213ENST00000431800 674 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 WBP1LP7-201ENST00000437905 363 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL158829.1-201ENST00000449258 478 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC104843.1-201ENST00000451203 319 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC002463.1-201ENST00000453459 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL355312.3-201ENST00000472053 312 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RN7SL280P-201ENST00000496490 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC024022.1-203ENST00000515392 478 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RPL10P9-201ENST00000522551 645 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MTND6P25-201ENST00000528711 516 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL352979.1-201ENST00000554238 297 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CYP19A1-210ENST00000557858 832 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC048383.1-201ENST00000558226 527 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 GATA6-AS1-201ENST00000579431 481 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL121985.1-203ENST00000588034 556 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ALG13-226ENST00000622986 582 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 XAF1-202ENST00000361842 3623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 HHAT-203ENST00000367010 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms