Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB2Q9Y5E7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms