Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMPXQ9UHP9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms