Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms