Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms