Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRP2BPQ9P2M1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP2BPQ9P2M1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms